| 姓 名： | 邓运 |
|---|---|
| 性 别： | 男 |
| 职 称： | 研究员 |
| 电 话： | 86-27-68780989 |
| 电子邮件： | dengyun@ihb.ac.cn |
简历介绍：
邓运，男，1985年出生，中国科学院水生所研究员。自2008年在华中农业大学生命科学与技术学院微生物学专业开展硕博研究生阶段的学习，于2015年获得博士学位。先后于2015-2019年和2019-2022年在华中农业大学和德国弗里德里希席勒耶拿大学从事博士后研究。2023-2024年在中国科学院水生生物研究所开展访问研究。2024年受聘于中国科学院水生生物研究所，任职于蓝藻生长发育与合成生物学研究组。
主要从事微生物与植物和藻类生态互作方向的研究。近年获得一定的学术成绩：构建了多伙伴的藻际微生物模型群落和人工生境，并利用单细胞显微观察和代谢组学等手段，揭示细菌通过诱导胞外囊泡的方式调控硅藻衰老的机制，为理解更复杂的藻华的生态演替提供理论基础；通过分子生物学和生物化学手段揭示植物内生细菌通过产生细菌素结合自身鞭毛蛋白来逃逸宿主天然免疫的内生定植机制，为开发更有效的生物化肥提供了理论基础。在Nature Microbiology，Annual Review of Marine Science，Communications Biology，Materials Horizons和Applied and Environmental Microbiology等杂志上发表论文十余篇。获得中国科学院引才项目的支持。
研究方向：
固氮蓝藻的植物内共生机制与应用
社会任职：
获奖及荣誉：
博士研究生国家奖学金（2014年）
湖北省大学生优秀科研成果二等奖（2008年）
代表论著：
1.Deng Y, Yu R, Grabe V, Sommermann T, Werner M, Vallet M, Zerfaß C, Werz O, Pohnert G. 2024. Bacteria modulate microalgal aging physiology through the induction of extracellular vesicle production to remove harmful metabolites. Nature Microbiology. DOI: 10.1038/s41564-024-01746-2
2.
Syhapanha K, Russo D, Deng Y, Meyer N, Poulin R, Pohnert G. 2023. Transcriptomic-guided identification of an algicidal protease of the marine bacterium Kordia algicida OT-1. MicrobiologyOpen. 10.1002/mbo3.1387.
3.Behrendt F#, Deng Y#, Stumpf S, Pretzel D, Fritz N, Pohnert G, Gottschaldt M, Schubert U. 2023. Dimethylsulfoniopropionate decorated cryogels as synthetic habitats of marine bacterial communities. Materials Horizons. DOI: 10.1039/d2mh01383e. (#equal contribution)
4.
Deng Y, Mauri M, Vallet M, Staudinger M, Allen R, Pohnert G. 2022. Dynamic diatom-bacteria consortia in synthetic plankton communities. Applied and Environmental Microbiology. 2022 Nov 22;88(22):e0161922.
5.Deng Y#, Vallet M#, Pohnert G. 2022. Temporal and spatial signaling mediating the balance of the plankton microbiome. Annual Review of Marine Science. 14:239-260. (#equal contribution)
6.
Deng Y, Chen H, Li C, Xu J, Qi Q, Xu Y, Zhu Y, Zheng J, Peng D, Ruan L, Sun M. 2019. Endophyte Bacillus subtilis evade plant defense by producing lantibiotic subtilomycin to mask self-produced flagellin. Communications Biology. 2: 368.
7.Deng Y, Li C, Zhu Y, Wang P, Qi Q, Fu J, Peng D, Ruan L, Sun M. 2014. A transmembrane protein responsible for subtilomycin immunity, ApnI, unveils a novel model for lantibiotic immunity. Applied and Environmental Microbiology. 2014 vol. 80 no. 20: 6303-6315.
8.
Wang P, Zhang C, Zhu Y, Deng Y, Guo S, Peng D, Ruan L, Sun M. 2013. The resolution and regeneration of a cointegrate plasmid reveals a model for plasmid evolution mediated by conjugation and oriT site-specific recombination. Environmental Microbiology. 15:3305-3318.
9.Deng Y, Zhu Y, Wang P, Zhu L, Zheng J, Li R, Ruan L, Peng D, Sun M. Complete genome sequence of Bacillus subtilis BSn5, an endophytic bacterium of Amorphophallus konjac with antimicrobial activity to plant pathogen Erwinia carotovora subsp. carotovora. Journal of Bacteriology. April 2011 vol. 193 no. 8 2070-2071.
10.
邓运, 田小海, 吴晨阳, 松井勤, 肖波. 热害胁迫条件下水稻花药发育异常的早期特征[J]. 中国生态农业学报(中英文), 2010, 18(2): 377-383. DOI: 10.3724/SP.J.1011.2010.00377.
