浪潮TS10000高性能计算集群，由1个管理节点、1个用户登录节点、2288TB磁盘存储以及81个计算节点组成，计算节点共计1156个颗CPU核心，具体配置如下：
管理节点：用于系统管理，普通用户无权登录。
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节点名 |
CPU型号与主频 |
核数 |
内存 |
硬盘 |
数量 |
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mu01 |
2*Intel Xeon E5-2620 v3(2.4GHz) |
12 |
32GB |
300GB |
1 |
用户登录节点：用于用户登录、编译以及通过作业调度系统提交管理作业等；
禁止用户在此节点上不通过作业调度系统直接运行作业。
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节点名 |
CPU型号与主频 |
核数 |
内存 |
硬盘 |
数量 |
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mu02 |
2*Intel Xeon E5-2620 v3(2.4GHz) |
12 |
32GB |
300GB |
1 |
刀片计算节点：74个
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节点名 |
CPU型号与主频 |
核数 |
内存 |
硬盘 |
数量 |
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c0101-c0142，
c0301-c0332 |
2*Intel Xeon X5650（2.67GHz） |
12 |
24GB |
150GB |
74 |
胖节点：6个
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节点名 |
CPU型号与主频 |
核数 |
内存 |
硬盘 |
数量 |
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fat01、fat02、fat03 |
4*Intel Xeon E7-4820 v3（1.90GHz） |
40 |
1T |
900GB |
3 |
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fat04、05 |
4*Intel Xeon Gold 5118（2.30GHz） |
48 |
1T |
900GB |
2 |
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c0401 |
4*Intel Xeon X7560 （2.27GHz） |
32 |
125GB |
150GB |
1 |
GPU计算节点：1个
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节点名 |
GPU |
CPU型号与主频 |
内存 |
硬盘 |
数量 |
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gpu01 |
2*NVIDIA Tesla K40m GPU卡 |
2*Intel Xeon E5-2650 v3（2.30GHz） 20核 |
125GB |
200GB |
1 |
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管理网络：通过千兆以太网互联
计算网络：通过40Gb QDR高速InfiniBand网络实现，旧IB网络采用20Gbps DDR实现，新旧交换机采用两根线缆连通。 |
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存储系统：Lustre并行文件系统 |
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操作系统：CentOS Linux release 7.2.1511 |
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编译器：Intel、PGI和GCC等C/C++、Fortran编译器 |
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作业调度：浪潮TSCE作业调度系统 |
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并行环境：Intel MPI和Open MPI等，支持MPI并行程序； |
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应用软件：目前已安装短序列比对软件Bowtie、序列拼接软件velvet、Trinity等生物信息软件。 |
中国科学院水生生物研究所
