2006. 9-2008. 3  法国国家科研中心分子细胞及遗传学研究所（IGBMC/CNRS）法中科学及应用基金会（FFCSA）博士后访问学者

2009.10-2009.12美国弗吉尼亚大学客座副教授（Visiting Associate Professor）

2012.10-至今国家斑马鱼资源中心主任

2019.3-至今国家水生生物种质资源库主任

2024.4-至今中国科学院水生生物研究所基因工程育种研究室主任

2002.7-至今中国科学院水生生物研究所助研、副研、研究员、二级研究员

1.鱼类生殖细胞发育

以斑马鱼等为模型，揭示鱼类生殖细胞（特别是卵细胞）发育及其质量控制的分子机制，以期从根本上提升养殖鱼类的配子质量和繁育能力。其具体内涵包括：1）阐释生殖干祖细胞（原始生殖细胞、生殖干细胞等）命运决定与分化的分子调控网络；2）揭示雌雄性配子（卵、精子）的发育程序和质量调控机制；3）发掘卵细胞储存的各类母源因子并揭示其调控受精卵和胚胎发育的分子机制。

2.鱼类前沿生物技术与定向育种

以斑马鱼、稀有鮈鲫、金鱼、草鱼等为材料，开展鱼类基因编辑配子“借腹生殖”等前沿育种生物技术的研究，以期建立未来鱼类配子超级工厂，超速创制养殖鱼类优异种质。其具体内涵包括：1）生殖细胞靶向高效的基因编辑技术研发；2）不同遗传距离鱼类间“生殖干祖细胞移植”等借腹生殖研究，重点攻克“借腹生殖”中“万能供体鱼”和“万能受体鱼”理论及其技术；3）研发多不饱和脂肪和虾青素含量等品质性状获得根本性提升的“海优鲤”等养殖鱼类新品种（系）。

主要从事鱼类生殖细胞发育与前沿生物育种技术研究。揭示了若干调控鱼类生殖细胞发育和胚胎发育的关键因子及其作用机制；首创鱼类诱导性原始生殖细胞（iPGC）的新理论和新技术；首次实现鱼类基因编辑配子的借腹生殖（也称“借腹怀胎”）前沿育种技术的突破；受命从零开始建成了全球三大库之一的国家斑马鱼资源中心（http://zfish.cn），牵头完成“斑马鱼1号染色体全基因敲除计划”，相关成果入选国家“十三五”科技创新成就展。先后主持国家重点研发计划“发育编程及其代谢调节”重点专项等一批科研项目。在Advanced Science、Genome Research、Nature Communications、PLOS Biology、Development以及Cell Research、Science Bulletin、Science China-Life Sciences等国内外学术刊物上发表论文120余篇。相关论文入选Springer Nature年度亮点论文，被Faculty of 1000专门推荐，被国际知名学者专项Research等。

代表性论文：

1)Chen, Z., He, M., Wang, H., Li, X., Qin, R., Ye, D., Zhai, X., Zhu, J., Zhang, Q., Hu, P., Sui, G.,Sun, Y.*(2024). An intestinal DHA-PA-PG axis promotes digestive organ expansion by mediating usage of maternally-deposited yolk lipids.Nature Communications, 15, 9769. 10.1038/s41467-024-54258-2.发现鱼类胚胎内源-外源营养转换调控的新机制

2)Li, X., Liu, C., Zhang, R., Li, Y., Ye, D., Wang, H., He, M., andSun, Y.*(2024). Biosynthetic deficiency of docosahexaenoic acid causes nonalcoholic fatty liver disease and ferroptosis-mediated hepatocyte injury.J Biol Chem, 107405. 10.1016/j.jbc.2024.107405.发现内源合成DHA促进鱼类肝脏脂质稳态的新机制

3)Wang, X., Zhu, J., Wang, H., Deng, W., Jiao, S., Wang, Y., He, M., Zhang, F., Liu, T., Hao, Y., Ye, D.,Sun, Y.*(2023). Induced formation of primordial germ cells from zebrafish blastomeres by germplasm factors.Nature Communications14, 7918. 10.1038/s41467-023-43587-3.（Research Highlight亮点推荐论文，“为鱼类生殖细胞诱导鸡尾酒干杯”）取得鱼类诱导性原始生殖细胞理论和技术的突破

4)Zhang, R., Tu, Y.X., Ye, D., Gu, Z., Chen, Z.X.*, andSun, Y.*(2022). A Germline-Specific Regulator of Mitochondrial Fusion is Required for Maintenance and Differentiation of Germline Stem and Progenitor Cells.Advanced Science9, e2203631. 10.1002/advs.202203631.（Back cover paper，背封面论文）揭示线粒体动态调控鱼类生殖干祖细胞发育的新机制

5)He, M., Jiao, S., Zhang, R., Ye, D., Wang, H., andSun, Y.*(2022). Translational control by maternal Nanog promotes oogenesis and early embryonic development.Development149. 10.1242/dev.201213.(in companion with Research Highlight recommendation entitled “Nanog: not just a pluripotency factor”,当期亮点论文)揭示母源Nanog通过全局性翻译控制促进鱼类卵质的新机制

6)Zhang, F., Hao, Y., Li, X., Li, Y., Ye, D., Zhang, R., Wang, X., He, M., Wang, H., Zhu, Z., andSun, Y.*(2022). Surrogate production of genome-edited sperm from a different subfamily by spermatogonial stem cell transplantation.Sci China Life Sci65, 969-987.  首次实现亚科间鱼类基因编辑配子的借腹生殖

7)He, M., Zhang, R., Jiao, S., Zhang, F., Ye, D., Wang, H., andSun, Y.*(2020). Nanog safeguards early embryogenesis against global activation of maternal β-catenin activity by interfering with TCF factors.PLOS Biology18, e3000561.揭示Nanog通过控制母源β-catenin活性保护早期胚胎发育的新机制

8)Sun, Y., Zhang, B., Luo, L., Shi, D.L., Wang, H., Cui, Z., Huang, H., Cao, Y., Shu, X., Zhang, W., et al. (2020). Systematic genome editing of the genes on zebrafish Chromosome 1 by CRISPR/Cas9.Genome Research30, 118–126.实现斑马鱼1号染色体全基因的系统性敲除，入选国家十三五科技创新成就展

9)Zhang, Q.#, Ye, D.#, Wang, H., Wang, Y., Hu, W., andSun, Y.*(2020). Zebrafish cyp11c1 Knockout Reveals the Roles of 11-ketotestosterone and Cortisol in Sexual Development and Reproduction.Endocrinology161, DOI:10.1210/endocr/bqaa048（2020-2023连续高被引论文）揭示11-KT和皮质醇调控性别发育和生殖的新机制

10) Zhang, F., Li, X., He, M., Ye, D., Xiong, F., Amin, G., Zhu, Z., andSun, Y.*(2020). Efficient generation of zebrafish maternal-zygotic mutants through transplantation of ectopically induced and Cas9/gRNA targeted primordial germ cells.Journal of Genetics and Genomics47, 37-47.(Faculty of 1000推荐论文)

11) Li, X., Zhang, F., Wu, N., Ye, D., Wang, Y., Zhang, X.,Sun, Y.*, and Zhang, Y.-A*. (2020). A critical role of foxp3a-positive Treg cells in maintaining immune homeostasis in zebrafish testis development.Journal of Genetics and Genomics.47, 37-47.（封面论文）

12) Ye, D., Zhu, L., Zhang, Q., Xiong, F., Wang, H., Wang, X., He, M., Zhu, Z., and Sun, Y.* (2019). Abundance of Early Embryonic Primordial Germ Cells Promotes Zebrafish Female Differentiation as Revealed by Lifetime Labeling of Germline.Mar Biotechnol (NY)21, 217-228.(Springer Nature 2019年度亮点论文)

13) Ye, D., Wang, X., Wei, C., He, M., Wang, H., Wang, Y., Zhu, Z., andSun, Y.*(2019). Marcksb plays a key role in the secretory pathway of zebrafish Bmp2b.PLOS Genetics15, e1008306.揭示Marckb调控形态发生素BMP分泌的新机制

14) Zhu, Z.Y., andSun, Y.H.(2000). Embryonic and genetic manipulation in fish.Cell Research10, 17-27.

专利：

1.   孙永华,朱作言,熊凤, Ishtiaq Ahmed, Mike Waters.一种鱼类持续激活生长激素受体基因及制备方法和用途.中国发明专利，授权日期：2013年5月1日；授权号：ZL 201110141084.7

2.   孙永华，熊凤，魏志强，朱作言。一种定向筛选同源重组PGC的载体及构建方法和应用.中国发明专利，授权日期：2015年1月7日；专利号：ZL 201310341471.4

3.   孙永华、庞少臣、王厚鹏、朱作言、康景轩。一种提高鱼类omega-3多不饱和脂肪酸的方法及应用.中国发明专利授权，授权日期：2016年1月20日；专利号：ZL 201410155088.4

4.   熊凤，孙永华，叶鼎，朱作言。一种用于原始生殖细胞靶向突变的转基因载体及制备方法和用途。中国发明专利授权，授权日期：2019年2月12日，专利号：ZL 201510809203.X

5.   李阔宇，孙永华。一种斑马鱼鱼苗养殖的装置。中国实用新型专利授权，授权日期：2020年8月18日，专利号：CN 211268169 U（已转化应用）

6.叶鼎，孙永华，张泉清，何牡丹，王厚鹏。一种可标记鱼类生殖干细胞的多克隆抗体的制备方法。中国发明专利授权，授权日期：2022年10月11日，专利号：ZL202110408610.5

7.孙永华，刘成杰，叶鼎。Elovl4b基因突变视网膜感光神经元病变斑马鱼模型的构建方法，2024年3月15日，专利号：：ZL 2021 1 1444510.4

论著：

Ye, D., andSun, Y.*(2021). Manipulating and Visualizing the Germline with Transgenic lines. In Dosch R. ed., Germline Development in the Zebrafish: Methods and Protocols,Methods in Molecular Biology, Vol. 2218, New York: Springer Nature. 265-276

孙永华，2012.鱼类转基因研究中几个观念的转变和鱼类原始生殖细胞操作.陈松林主编，转基因水产动植物的发展机遇与挑战，中国科学技术出版社

孙永华, 2010.鱼类基因操作的技术创新及其在鱼类遗传育种当中的应用,陈松林主编，基因资源与现代渔业.中国科学技术出版社, pp. 76-81.

Sun, Y., Zhu, Z., 2003. Producing transgenic fish for aquaculture., in: Lee, C.-S. (Ed.),Aquaculture: retrospective and outlook.A joint publication of Asian fisheries society and American fisheries society. Asian Fisheries Society, Manila, Philippines and World Aquaculture Society, Louisiana, USA, pp. 229-246.

2024法中科学与应用基金会“卡恩-冈”奖

2021中国动物学会长隆奖

2021首批中国科学院特聘核心岗位科学家

2020国家杰出青年科学基金

2016中国科学院青年创新促进会优秀会员

2016首届中国水产学会青年科技奖

2011首届国家自然科学基金优秀青年科学基金

2011中国科学院卢嘉锡青年人才奖

国际斑马鱼学会理事兼提名委员会委员

中国实验动物学会理事、水生实验动物专委会主任委员

中国动物学会理事、斑马鱼分会副理事长兼秘书长、发育生物学分会理事

中国遗传学会模式生物遗传学分会副主任委员

中国细胞生物学会发育生物学分会委员

中国水产学会水产生物技术与遗传育种专业委员会委员

Water Biology and Security编委

Agriculture编委

Zoological Research编委

遗传编委