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仪器的基本信息
仪器名称:长片段高通量测序系统
英文名称:Long fragment of high-throughput sequencing system
型 号:Miseq
制 造 商:illumina
产 地:美国
购买年份:2013年
存放地点:分析测试中心416
管理人员:乔志仙
联系电话:027-68780783
仪器的用途
该系统主要用于未知物种全基因组测序,已知物种再测序,全基因表达组定量分析,全基因组小RNA分析,染色质免疫互沉淀(ChIP)研究,转录组分析,扩增子测序,定向重测序
仪器的性能指标
1高数据通量:每次反应可生成15G碱基数据;
2每次运行至少可生成单端25M、双端50M reads;
3可以在8小时内完成样品制备、测序和数据分析,用于快速鉴定;
4数据读长:单端或者双端读长可达到300bp;
5样品用量:DNA样本需1ug;
6读取精度:当测序长度为2 x150bp时,80%以上的碱基数据质量高于Q30,当测序长度为2 x300bp时,70%以上碱基数据质量高于Q30;
7可精确读取≥12个的连续单个重复碱基(AAAAAAAAAAAAAAA);
8不同样品并行性:提供稳定成熟的96个样品的index混合接头;
9可同时进行96个样品的1536重PCR产物的测序;
10测序结果给出严格的Q30的数据;
11扩增、测序和数据分析服务器在同一台仪器上完成;
12提供简单优化的生物信息学支持软件:如新物种拼接,小RNA分析,扩增子分析,重测序,16S宏基因组分析,文库质量QC等;
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