水生生物多样性与资源保护研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 曹文宣
• 陈毅峰
• 何德奎
• 何舜平
• 刘春龙
• 刘焕章
• 王丁
• 王剑伟
• 王克雄
• 谢志才
• 张鹗

淡水生态学研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 蔡庆华
• 曹特
• 陈宇顺
• 陈隽
• 段明
• 郭传波
• 韩冬
• 解绶启
• 金俊琰
• 刘家寿
• 倪乐意
• 唐涛
• 王洪铸
• 谢平
• 徐军
• 张堂林
• 朱晓鸣

鱼类生物学及渔业生物技术研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 昌鸣先
• 桂建芳
• 胡炜
• 李爱华
• 李文祥
• 罗大极
• 聂品
• 孙永华
• 童金苟
• 汪亚平
• 王桂堂
• 王忠卫
• 谢海侠
• 徐镇
• 张义兵
• 周莉
• 朱作言

水环境工程研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 曹秀云
• 陈联国
• 方涛
• 李敦海
• 李根保
• 李清曼
• 刘碧云
• 刘剑彤
• 邱东茹
• 宋康
• 王高鸿
• 吴辰熙
• 吴振斌
• 肖邦定
• 周炳升
• 周巧红

水生生物分子与细胞生物学研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 曹宏
• 葛峰
• 韩丹翔
• 侯宏伟
• 李涛
• 孙玉华
• 夏晓勤
• 肖武汉
• 熊杰
• 殷战
• 赵进东
• 缪炜

藻类生物学及应用研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 毕永红
• 甘南琴
• 胡春香
• 胡晗华
• 黄开耀
• 刘国祥
• 宋立荣
• 徐旭东
• 张承才
• 张学治

淮安研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 宁德刚

水生生物数据分析平台 (按姓氏首字母排序)

• 甘小妮

科研业务处 (按姓氏首字母排序)

• 贺锋